Además realiza catorce partidos de carácter amistoso y una gira por Europa.
Durante el desarrollo del Mundial Francia 98, la Selección Mexicana se convierte en un equipo sensación, ya que en todos sus partidos de la primera ronda tiene que remontar marcadores diversos, es con un empate memorable ante Holanda en el tercer partido de la primera fase cuando obtiene su calificación a los octavos de final en donde enfrenta a Alemania y cae derrotada por dos goles a uno. La Selección Mexicana obtiene nuevamente el 13vo lugar en la clasificación final.
En el año de 1999 la Selección Nacional se prepara para enfrentar tres compromisos de suma importancia, en el mes de febrero la Copa USA, en julio la Copa América en Paraguay e indiscutiblemente el evento de mayor jerarquía la Copa FIFA Confederaciones que se disputaría en las sedes de: ciudad de México y Guadalajara.
Previo a la Copa USA, el equipo mexicano disputa la Copa Carlsberg, torneo celebrado en Hong Kong, obteniendo el campeonato.
En la Copa USA celebrada en Los Ángeles y San Diego México reafirma su poderío y obtiene nuevamente el primer lugar del torneo de Concacaf.
Antes de viajar a Sudamérica para la disputa de la Copa América Paraguay, la Selección Nacional participa en la Copa Corea y obtiene un segundo lugar.
México se presenta nuevamente en el escenario sudamericano para su participación en la Copa América, durante la primera fase enfrenta a Chile y lo vence por uno a cero, posteriormente juega con Brasil y cae dos a uno y obtiene su pase a la siguiente ronda enfrentando a Venezuela a quien le gana tres tantos a uno.
En la segunda fase enfrenta al equipo peruano a quien vence en serie de penales y gana su derecho para estar en la semifinal, ahí enfrenta nuevamente a Brasil obteniendo un resultado adverso de dos goles, con esto obtiene su boleto para disputar por tercera ocasión en cuatro participaciones el tercer lugar de este torneo y lo hace contra la Selección Chilena a quien vence nuevamente y así obtiene esta importante posición.
Durante los meses de julio y agosto de 1999 la Selección Nacional Mexicana enfrenta la Copa FIFA Confederaciones, el segundo torneo en importancia para la FIFA después de la Copa del Mundo, en este torneo participan Brasil y Alemania entre otros. México disputa cinco encuentros obteniendo cuatro triunfos y un empate calificándose a la final junto con Brasil a quien derrota de manera inobjetable por cuatro goles a tres, en un partido por demás espectacular. Obteniendo el primer campeonato oficial en su historia.
La Selección Mexicana termina 1999 con tres juegos amistosos, ante Paraguay, Colombia y Ecuador, el primero lo pierde por la mínima diferencia y los otros dos los empata a cero goles.
Para el inicio del 2000 participa en tres amistosos, en los que le gana a Irán, Rumania y empata con Guatemala a 1 gol.
La Selección se dispone a refrendar los títulos obtenidos en las Copas Carlberg y Copa de Oro, proezas que no pudieron ser cumplidas.
México se prepara para iniciar la eliminatoria mundialista y enfrenta en partidos amistosos a El Salvador y Venezuela a los cuales les gana.
Dentro de la eliminatoria rumbo al Mundial 2002, México visita Panamá, en donde a pesar de la maltratada cancha sale triunfador con resultado de un gol a cero, para después visitar, puerto España y enfrentar a Trinidad y Tobago, quien le gana a México por la mínima diferencia en un encuentro muy cerrado.
En el encuentro que marca el regreso de la Selección Mexicana al Estadio Azteca, el 15 de agosto, México, recibe a los canadienses venciéndolos por dos goles a cero.
Para el 3 de septiembre los mexicanos son anfitriones de Panamá, selección a la que se le gana con el marcador de 7 goles a 1.
Para encarar a Trinidad a Tobago, México se prepara y en amistoso en el Estadio Qualcom de San Diego, le vence 2 goles a 0 a Ecuador, en el encuentro que marca el debut de Enrique Meza como Técnico Nacional y el regreso a la Selección del goleador Jared Borgetti; también como preparación México supera por la mínima diferencia a la escuadra boliviana.
Llega el día que México espera, el 8 de octubre fecha del encuentro contra los trinitarios, la Selección Nacional juega bien conjuntada y se le gana a los visitantes por amplio resultado de 7-0, lo lamentable del encuentro es la lesión que sufre el mexicano Cuauhtémoc Blanco a manos de Ansil Elcock.
Para finales de octubre la Selección visita Los Ángeles para enfrentar en amistoso a la Selección de los Estados Unidos, resultando el primer descalabro en la era Enrique Meza, el resultado fue de 2-0.
El 15 de noviembre se lleva a cabo en Toronto Canadá el ultimo partido de la ronda eliminatoria y la Selección Nacional, empata sin goles con la escuadra de la hoja de maple, terminando México en segundo lugar del grupo "c", sumando 13 puntos resultado de 4 juegos ganados, uno empatado y uno perdido, 17 goles a favor y solo 2 en contra y así calificando junto con Trinidad y Tobago al hexagonal final en busca de un boleto para asistir al Mundial de Japón-Corea a celebrarse en el 2002.
El ultimo encuentro del año para la Selección Nacional es un amistoso contra Argentina en el Memorial Coliseum de Los Ángeles, donde el marcador es de 2-0, a favor de Argentina.
De febrero a noviembre de 2001 México disputara el hexagonal final rumbo a Japón-Corea 2002, además participara en la Copa América, donde compartirá el grupo "b" con las selecciones de Brasil, Paraguay y Perú.
Para encarar el primer partido de la eliminatoria mundialista, ante Estados Unidos, México participa en 2 partidos amistosos, el primero ante la Selección de Bulgaria en Morelia Michoacán, encuentro en donde los visitantes se imponen por 2-0 y contra Colombia en los Ángeles, California, en donde México cae dos goles por tres.
El primer encuentro eliminatorio, para clasificar al mundial Corea-Japón 2002, se realiza en la fría ciudad de Columbus en Ohio, donde México cae derrotado por marcador de 2 goles a 0.
La Selección Nacional se enfrenta en partido amistoso a Brasil, el 7 de marzo en la Ciudad de Guadalajara, el resultado de este encuentro es un empate a tres goles.
En el segundo encuentro de la eliminatoria mundialista México recibe a Jamaica, el 25 de marzo en el Estadio Azteca, los nacionales ganan este partido con marcador de cuatro tantos a cero.
Previo al juego con los trinitarios, México se mide el 11 de abril en enfrentamiento amistoso en Monterrey, Nuevo León a la Selección Chilena, a la cual se le gana por marcador de un gol a cero.
El 25 de abril, el tricolor visita Puerto España, para jugar su tercer partido de la ronda eliminatoria, en el cual le corresponde jugar contra Trinidad y Tobago en el parque de la reina, empatando a un gol; Exactamente un mes después México visita a la Selección Inglesa en partido amistoso y cae por marcador de cuatro tantos a cero.
La Selección Mexicana participa como campeón defensor en la Copa Confederaciones 2001, misma que se realiza en Corea y Japón . El equipo mexicano abre su participación contra Australia el 30 de mayo y pierde este compromiso por dos goles a cero, para el primero de junio la Selección se enfrenta a corea quien le gana por marcador de dos tantos contra uno, para terminar su participación en la copa el 3 de junio, perdiendo contra el equipo francés por cuatro goles a cero. Sin duda una Copa Confederaciones para olvidar.
México regresa al Estadio Azteca el 16 de junio para recibir a Costa Rica en partido de la eliminatoria mundialista y cae por marcador de dos a uno, cuatro días después visita a Honduras y los locales ganan este encuentro tres a uno. Al termino de este partido el Sr. Enrique Meza presenta su renuncia.
El día 21 de junio es presentado Javier Aguirre como técnico del tricolor.
Aguirre debuta el primero de julio al recibir a los Estados Unidos en partido de la eliminatoria mundialista en el Estadio Azteca y la escuadra nacional gana por uno-cero.
México parte a tierras colombianas, específicamente a Cali, para participar en la Copa América 2001, en la primera ronda México enfrenta el 12 de julio, a su similar de Brasil y sale con la victoria al derrotarlos por uno a cero.
México empata tres días después ante Paraguay a cero goles, para terminar la primera fase el tricolor juega con Perú y pierde por un gol a cero, esto el 18 de julio.
Con estos resultados México califica a cuartos de final y se tiene que trasladar a Pereira, en donde el 22 de julio le gana a la Selección Chilena por dos goles a cero.
Ahora el rival de México en semifinales es Uruguay y México sale airoso al enfrentarse a ellos el 25 de julio y ganarle por marcador de dos goles a uno.
La hazaña de la Selección Nacional era enfrentar a Colombia en la final de la Copa América 2001, encuentro realizado el 29 de julio y México cae un gol por cero, siendo Sub-campeón de la copa.
La Ciudad de Veracruz y el Estadio Luis"Pirata" Fuente serian después de 10 años nuevamente anfitriones de la Selección Nacional, esto ocurrió el 23 de agosto en que los mexicanos recibieron a la Selección de Liberia y en un encuentro de poder a poder la Selección Mexicana triunfa por marcador de 5-4.
México sigue disputando la clasificación al mundial, visita la Ciudad de Kingston, el dia 2 de septiembre y le gana a los locales por tres goles a uno, para tres días después recibir a las Selección de Trinidad y Tobago, en un Estadio Azteca que presento magnifica entrada los mexicanos levantan la cara y derrotan tres tantos a cero a los trinitarios.
Mes de octubre, dia 7, la Selección visita en encuentro de vida o muerte a los costarricenses. Y en la ciudad de San José de Costa Rica, México consigue un empate a cero goles, que en combinación de resultados coloca a los aztecas en tercera posición.
Para el 31 del mismo mes la Selección se presenta en el estadio Cuauhtémoc de Puebla para recibir en amistoso a El Salvador y le gana por cuatro goles a uno.
El 11 de noviembre seria un dia histórico para todo México ya que la Selección se jugaba el todo por el todo ante su similar de Honduras a quien derrota por tres a cero y con la combinación de resultados que se dio con la derrota de Jamaica ante Costa Rica por uno a cero y el empate a cero goles de Estados Unidos en Trinidad & Tobago, México se califica al Mundial de Corea/Japon 2002 y se coloca en la segunda posición de su grupo.
El primer encuentro del año 2002 para los tricolores se realiza en Pasadena California el 19 de enero, dentro de la Copa de Oro y México gana por uno a cero.
Dos días después se enfrentarían a Guatemala, los mexicanos vencen por tres goles a uno a los chapines, para calificarse a la segunda fase en donde se enfrentan a Corea en un partido que termina a cero goles. En penales los asiáticos derrotan a México por cuatro a dos.
Para el 13 de febrero la Selección continua con sus encuentros de preparación rumbo al Mundial y en Phoenix, Arizona recibe a la Selección de Yugoslavia, equipo que le gana a los mexicanos por dos goles a uno.
Siguiendo con la preparación rumbo al Mundial, México recibe en San Diego a Albania, sinodal que el 13 de marzo cae por cuatro tantos ante el equipo nacional mexicano.
Para el 4 de abril de 2002 se jugaría de preparación ante los Estados Unidos y la Selección Nacional es derrotada por un gol a cero, en Denver, Colorado.
Los juegos amistosos Rumbo a la Copa del Mundo Japon/Corea continúan y para el 17 de abril de 2002, tocaría a Bulgaria ser rival de México.
El Estadio de los Gigantes rememora, aquel partido del Mundial Estados Unidos 94, en que el mismo equipo búlgaro derrotaría a México en penales, pero la historia es diferente en esta ocasión y el equipo tricolor le gana con gol de ultimo minuto a la Selección Búlgara.
En el encuentro que marca la despedida de su afición, antes de viajar al Mundial Corea/Japon, la Selección Nacional, enfrenta a su similar de Colombia, el 12 de mayo de 2002.
El conjunto tricolor derrota por marcador de dos goles a uno, a los visitantes, y están listos para viajar a su gira previa a la Copa del Mundo.
La Selección inicia la serie de juegos que preceden a la Copa del Mundo, jugando en San Francisco, el 16 de mayo, lugar en donde recibe a Bolivia, Selección a la que le gana por marcador de un gol a cero, para tres días después es decir el 19 de mayo, la Selección recibe a Milán, en los Ángeles California, y México gana por dos goles a uno.
El equipo mexicano viaja al oriente, su lugar de concentración es Fukui en Japón, en este lugar en partido amistoso le gana al Tokio Verdi por marcador de dos tantos a uno y esta listo para empezar la Copa del Mundo.
3 de junio, el dia esperado para todos los mexicanos, el equipo tricolor enfrenta a Croacia en Niigata, al cual se le gana por un gol a cero, para iniciar el Mundial con el pie derecho.
9 de junio, Miyagi, Japón, México ante Ecuador, el equipo nacional, derrota por dos goles a uno a los ecuatorianos, y el 13 de julio la Selección juega ante Italia, en Oita, Japón y empatan a un gol, con lo que la Selección califica a octavos de final de la Copa del Mundo.
El 17 de junio, la Selección enfrenta a Estados Unidos en Chonju, Corea y cae por marcador de dos goles a cero, con lo que se cierra la historia de México en la justa mundialista de Japon/Corea 2002.
Al termino de la Copa del Mundo Japón / Corea 2002, Javier Aguirre deja el timón de la Selección Nacional; El 22 de Octubre y luego de gran expectación por saber quien ocuparía el cargo de Técnico Nacional, es presentado Ricardo Lavolpe.
El 14 de enero del 2003, Lavolpe da a conocer su primera lista como seleccionador y sorprende por la inclusión de varios jóvenes.
El 4 de febrero, la Selección enfrenta en partido Amistoso a la Selección de Argentina en Los Ángeles; México cae por uno a cero; Para el 12 del mismo mes, México empata con Colombia a cero goles en el Estadio One Ball Park de Phoenix, Arizona.
El 19 de marzo, 2003. Bolivia es el rival y en el Estadio Texas que cuenta con pasto artificial, la Selección de México gana con anotaciones de Jesús Olalde y Pavel Pardo, por dos a cero.
El Estadio Qualcomm es anfitrión de las Selecciones de Paraguay y México el 26 Marzo. El partido termina empatado a un gol, con anotaciones de Christian Patiño por los tricolores y José Cardozo por los paraguayos.
Guadalajara se viste de fiesta al ser designada para celebrar el partido amistoso entre las Selecciones de México y Brasil en el Estadio Jalisco, el 30 de abril del 2003.
Carlos Alberto Parreira convoca a las grandes figuras amazónicas para enfrentar al tricolor, y con la presencia de Ronaldo, Ronaldinho, Dida, Diego, Robinho y demás estrellas, México encara bien este juego, en donde por los nacionales destaca la actuación del arquero Oswaldo Sánchez, del defensa Rafael Márquez y de Ramón Morales, para mantener el marcador empatado sin goles.
En un partido que ya se ha convertido en un clásico, México enfrenta a Estados Unidos, el 8 de mayo en el Reliant Stadium de la Ciudad de Houston, Texas; el marcador termina empatado a cero goles.
El último encuentro amistoso de la Selección Nacional, previo a la Copa Oro Concacaf 2003, es en el Estadio Home Depot, de la Ciudad de Los Angeles, California; en donde el conjunto tricolor cae derrotado por dos goles a uno contra la Selección de El Salvador.
La Copa Oro, el Campeonato para Selecciones Nacionales de la Confederación Norte, Centroamericana y del Caribe de Futbol, se juega por primera vez en un país fuera de los Estados Unidos y es designada como sede la Ciudad de México, además de Foxboro, Massachussets y Miami, Florida.
La Copa de Oro Concacaf 2003 se desarrolla del 12 al 27 de Julio de 2003. Doce selecciones toman parte otra vez, incluyendo a dos equipos visitantes de Conmebol, el Campeón de la Copa Mundial 2002: Brasil, así como el Campeón de la Copa América 2001: Colombia.
México inicia su participacion derrotando el 13 de julio a su similar de Brasil por un gol a cero, en encuentro celebrado en el Estadio Azteca, sede de todos los partidos de la Selección Mexicana en este torneo.
Para el 17 de julio, México consigue su pase a la siguiente fase al derrotar a Honduras por dos tantos a cero.
El proximo rival del tricolor es Jamaica, Selección a la que los locales vencen el 20 de julio, por marcador de cinco tantos a cero, con lo que se clasifica a Semifinales de la Copa Oro, En esta fase la Seleccion mexicana derrota a Costa Rica por dos goles a cero, el 24 de julio de 2003.
27 de Julio 2003, Gran Final de la Copa Oro 2003; Brasil el rival, durante los noventa minutos del encuentro, el balón no logro cruzar la meta, lo que obligo al alargue y a los tiempos extras, con el nerviosismo que acompaña al Gol de Oro.
El tanto que colocó a México como máximo ganador de la Copa Oro, fue conseguido al minuto 7 del primer tiempo extra por el jugador Daniel Osorno, quien luego de quitarse a dos adversarios disparo a la meta que defendía Gomes.
El primer encuentro amistoso, despues de la obtención de la Copa Oro 2003; fue el 20 de agosto ante Perú en Nueva Jersey; el cuadro tricolor cayó por marcador de tres goles a uno, en un partido que sera recordado por que, durante algunos minutos ambos conjuntos abandonaron el terreno de juego, luego de un conato de bronca.
El 15 de octubre la Selección Mexicana enfrentó en Chicago a Uruguay de manera amistosa; el cuadro Sudamericano derrotó al conjunto tricolor por dos goles a cero.
En el último partido del año 2003, para la Seleccion Nacional Mexicana, esta enfrentó en San Francisco a su similar de Islandia, en un juego que culminó con empate a cero goles
